Aby można było realizować różne aplikacje wykorzystując przekaźnik programowalny należy przede wszystkim stworzyć odpowiedni program i umieścić go w pamięci sterownika. Po uruchomieniu sterownik zaczyna przetwarzanie programu - od pierwszej instrukcji do ostatniej, po czym cykl jest powtarzany.
Na początku każdego cyklu stany wejść są zapisywane do specjalnych obszarów pamięci. W trakcie programu następuje odwołanie się nie do bezpośrednich stanów wejść/wyjść, ale do ich kopii umieszczonych w pamięci odwzorowującej proces. Podobnie jest z sygnałami wyjściowymi. Sterownik zapamiętuje te stany w pamięci odwzorowania procesu i dopiero z końcem każdego cyklu następuje przepisanie tychże stanów do wyjść przekaźnika.